英国

TwistDx 

Inc

公司开发的重组酶聚合酶扩增

(Recombinase 

Polymerase 

Amplification

RPA)

,被称为是可以替代

PCR

的核酸检测技术。

RPA

技术主要

依赖于三种酶:能结合单链核酸

(

寡核苷酸引物

)

重组酶

单链

DNA

结合蛋白

(SSB)

链置换

DNA

聚合酶

。这三种酶的混合物在常温下也有活性,最佳反应

温度在

37°

C

左右。

 

RPA

技术特点

 

常规

PCR

必须经过变性、退火、延伸三个步骤,而

PCR

仪本质上就是一个

控制温度升降的设备。

RPA

反应的最适温度在

37

-42

℃之间,无需变性,在常

温下即可进行。这无疑能大大加快

PCR

的速度。此外,由于不需要温控设备,

RPA

可以真正实现便携式的快速核酸检测。

 

据介绍,

RPA

检测的灵敏度很高,能够将痕量的核酸(尤其是

DNA

)模板

扩增到可以检出的水平,

从单个模板分子得到大约

1012

扩增产物。

而且

RPA

用不着复杂的样品处理,适用于无法提取核酸的实地检测。

 

RPA

既可以扩增

DNA

也可以扩增

RNA

还省去了额外的

cDNA

合成步骤。

不仅可以对扩增产物进行终点检测,

还可以对扩增过程进行实时监控,

甚至可以

通过试纸条(侧流层析试纸条

LFD

)读取结果。

 

目前,

TwistAmp® 

试剂盒的扩增子长度在

500bp

以内。不过,经过特别优

化的

RPA

扩增,也可以生成更长的扩增产物,或者减慢扩增速度(便于定量),

甚至在更低的温度下进行反应。

 

RPA

技术原理

 

首先重组酶与引物结合形成的蛋白

-DNA

复合物,在双链

DNA

中寻找同源

序列。然后一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动

DNA

成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的

DNA

链与

SSB

结合,防止

进一步替换。

在这个体系中,

由两个相对的引物起始一个合成事件。

整个过程进

行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。

 

RPA

扩增的基础体系

TwistAmp® Basic

含有

DNA

扩增所需的所有试剂,

只要准备好引物和模板就行。

扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,

产物纯

化后可用于下游研究。

 

在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的

RPA

应用。

举例来说,

TwistAmp® Basic RT

添加了逆转录酶,

可以对

RNA

模板进行一步法

扩增。

 

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