如何用primer5设计PCR引物并转化成pdf格式
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   PCR扩增中,引物的设计是很重要的一部分,那么如何用primer5设计引物呢,下面给大家分享一下我的经验:

工具/原料

  • primer5
  • 基因序列

方法/步骤

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    先在NCBI这个网站上找到自己需要的基因序列,mRNA或者DNA都可。

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    如下,是我找的大鼠肥大细胞MrgB3基因的NCBI序列。

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    运行Primer 5.exe。

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    点击左上角File-New-DNA Sequence。

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    该信息未经授权抓取自百度经验
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    得到下面这个页面,将自己得到的DNA或者RNA粘贴至空白处。

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    粘贴之后会弹出窗口,系统自动选择“As is”,直接点击OK即可。

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    粘贴成功,点击“primer”,在左上方弹出窗口,选择“search”,弹出引物搜索框,其他选项一般不需要更改,如果需要的产物长度有些要求可以更改,如果无需更改,或者更改完毕后点击“OK”。

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    自动搜索完毕后,弹出下面这个窗口,点击“OK”,右上角出现搜索结果,并且按系统评分排序,共一百对引物。

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    点击某一行结果,在左上角的“引物窗口”中,会显示该引物的详细信息。

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    通过对比查看引物,从中选择合适的引物:在搜索结果框中该引物一行的方框后打对勾。点击Fuction-Save to datebase,弹出“primer database ”对话框,点击自己要加的引物序列,点击“Export”,引物序列就会在“Primers”下方出现,点击“Save”,以后即可查看。

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    如果合适的引物就一两个,也可以直接用虚拟打印机转化成pdf格式。前提是要有一个虚拟打印机的软件,我用的是bio PDF软件。点击合适的引物,点击File-Print-Current Pair,弹出“Print primer”窗口,点击“print”。

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    弹出“打印设置”选项,直接确定即可,弹出PDF生成文件,点击“保存”,在桌面上就有了该pdf文件,文件里面记录该序列详细信息。

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    END

注意事项

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作者声明:本篇经验系本人依照真实经历原创,未经许可,谢绝转载。
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